美洲大蠊的基因组数据比人的数据还大
美洲大蠊的基因组数据比人的数据还大
“美洲大蠊作为一种古老的物种,其基因组含有大量的重复序列,属于复杂基因组,这为测序工作带来了巨大的难度。”对于给“小强”基因测序,中国医学科学院药用植物研究所所长孙晓波很有感触。
主持这次测序研究的四川大学生命科学院岳碧松教授介绍,测序结果表明,美洲大蠊的基因组大小约为3.2Gb,比人的基因组还要大,重复序列含量特别高,杂合度也高,属于复杂基因组,给测序、组装、注释等都带来了不小的困难。
基因测序工作蕴含着大量的第一次:首次通过二代测序技术获得质控数据1.4Tb,测序深度超过400X; 首次获得美洲大蠊高质量基因组, 经过组装,最后得到3.19Gb基因组序列,组装基因组已覆盖美洲大蠊全基因组的95%; 首次完成了美洲大蠊基因注释, 最终得到基因数为13612个……
背后,还有企业大胆创新的很多个第一次:好医生药业集团建立了国内第一家通过国家食药监局认证的美洲大蠊GAP养殖基地;建立了国内第一个药用美洲大蠊四川省重点实验室,药用动物四川工程技术研究中心……
孙晓波表示,本次测序工作揭示了美洲大蠊这一古老生物的生命密码,通过解读其遗传信息,分析物种经过漫长的进化历史,成功适应存活的原因,为下一步优化种源及养殖技术奠定了基础;通过对基因组进一步分析,有助于揭示美洲大蠊活性成分有关的基因调控及代谢通路,为新药开发提供新的思路。
主持这次测序研究的四川大学生命科学院岳碧松教授介绍,测序结果表明,美洲大蠊的基因组大小约为3.2Gb,比人的基因组还要大,重复序列含量特别高,杂合度也高,属于复杂基因组,给测序、组装、注释等都带来了不小的困难。
基因测序工作蕴含着大量的第一次:首次通过二代测序技术获得质控数据1.4Tb,测序深度超过400X; 首次获得美洲大蠊高质量基因组, 经过组装,最后得到3.19Gb基因组序列,组装基因组已覆盖美洲大蠊全基因组的95%; 首次完成了美洲大蠊基因注释, 最终得到基因数为13612个……
背后,还有企业大胆创新的很多个第一次:好医生药业集团建立了国内第一家通过国家食药监局认证的美洲大蠊GAP养殖基地;建立了国内第一个药用美洲大蠊四川省重点实验室,药用动物四川工程技术研究中心……
孙晓波表示,本次测序工作揭示了美洲大蠊这一古老生物的生命密码,通过解读其遗传信息,分析物种经过漫长的进化历史,成功适应存活的原因,为下一步优化种源及养殖技术奠定了基础;通过对基因组进一步分析,有助于揭示美洲大蠊活性成分有关的基因调控及代谢通路,为新药开发提供新的思路。
yongbuyanbai2- 帖子数 : 994
注册日期 : 12-07-25
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美洲大蠊独有的特征。传统中医认为,蜚蠊科入药动物有活血散瘀,解毒消疳,利尿消肿等攻效果。可见美洲大蠊用于肿瘤的治疗有着上千年的历史。
现代研究发现,美洲大蠊表皮含有巩膜质和甲壳质,溴、锌、镍、锰、钾、钙、钛、氯、硫、硅、铝、镁等元素。肌肉水解13种氨基酸。此外,身体贮藏微生素B1B2,烟酸和抗坏血酸等,淋巴含海藻糖、海藻糖酶、糖蛋白、肌醇、原儿茶酸葡萄甙等。全体含麦角硫因、龙虾肌碱、胡芦巴碱、甘氨酸、甜菜碱、肛碱、三甲胺、腺嘌呤等。科学的解释了其在药理方面的突出作用。
现代研究发现,美洲大蠊表皮含有巩膜质和甲壳质,溴、锌、镍、锰、钾、钙、钛、氯、硫、硅、铝、镁等元素。肌肉水解13种氨基酸。此外,身体贮藏微生素B1B2,烟酸和抗坏血酸等,淋巴含海藻糖、海藻糖酶、糖蛋白、肌醇、原儿茶酸葡萄甙等。全体含麦角硫因、龙虾肌碱、胡芦巴碱、甘氨酸、甜菜碱、肛碱、三甲胺、腺嘌呤等。科学的解释了其在药理方面的突出作用。
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